Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms