Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4D4

1700064H15Rik, RIKEN cDNA 1700064H15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700064H15RikD3Z4D4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
1700064H15RikD3Z4D4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700064H15RikD3Z4D4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms