Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12cD3Z3L3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12cD3Z3L3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms