Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms