Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm3543D3Z235 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm3543D3Z235 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3543D3Z235 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm3543D3Z235 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3543D3Z235 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3543D3Z235 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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