Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SafbD3YXK2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SafbD3YXK2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms