Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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BC048679D3YXE9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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BC048679D3YXE9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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BC048679D3YXE9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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