Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rexo5D3YW29 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rexo5D3YW29 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rexo5D3YW29 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rexo5D3YW29 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rexo5D3YW29 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rexo5D3YW29 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rexo5D3YW29 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Rexo5D3YW29 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms