Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Gm17333C6EQI3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm17333C6EQI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Gm17333C6EQI3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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