Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc5C3VPR6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc5C3VPR6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc5C3VPR6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc5C3VPR6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc5C3VPR6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc5C3VPR6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc5C3VPR6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc5C3VPR6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc5C3VPR6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms