Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd8B9EJ80 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms