Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms