Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms