Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cspp1B2RX88 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms