Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rd3lB2RV38 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms