Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms