Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms