Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc22a28B2RT89 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc22a28B2RT89 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms