Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrn3B2RS91 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrn3B2RS91 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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