Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud4B2RRE7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms