Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CadB2RQC6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CadB2RQC6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms