Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AU022751B1B0V2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AU022751B1B0V2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms