Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb8B1AY40 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ssxb8B1AY40 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssxb8B1AY40 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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