Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms