Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms