Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms