Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtprsB0V2N1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprsB0V2N1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprsB0V2N1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PtprsB0V2N1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PtprsB0V2N1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprsB0V2N1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PtprsB0V2N1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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