Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem238A9JSM3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms