Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint5A7XUY5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint5A7XUY5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms