Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Pm20d2A3KG59 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms