Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CatsperbA2RTF1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms