Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt1lA2RSY6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt1lA2RSY6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms