Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xlr4aA2BI40 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xlr4aA2BI40 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms