Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syndig1A2ANU3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms