Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn6A2AJB9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Lcn6A2AJB9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lcn6A2AJB9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms