Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc25a53A2AF28 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc25a53A2AF28 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms