Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp8nlA2ABX0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms