Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef6A2A8M8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef6A2A8M8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef6A2A8M8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef6A2A8M8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef6A2A8M8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pramef6A2A8M8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef6A2A8M8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms