Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb4A2A863 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb4A2A863 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms