Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smurf2A2A5Z6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf2A2A5Z6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf2A2A5Z6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf2A2A5Z6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smurf2A2A5Z6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms