Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm27029A2A4P4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms