Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms