Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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