Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1bA0A0A6YXJ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms