Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trbv23A0A0A6YWQ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trbv23A0A0A6YWQ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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