Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv31A0A075B5J5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trbv31A0A075B5J5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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