Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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RpainQ9CWY9 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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RpainQ9CWY9 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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RpainQ9CWY9 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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RpainQ9CWY9 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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RpainQ9CWY9 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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RpainQ9CWY9 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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RpainQ9CWY9 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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RpainQ9CWY9 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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