Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cln3Q61124 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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Cln3Q61124 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cln3Q61124 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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