Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Igkv12-89-201ENSMUST00000103335 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Col15a1-204ENSMUST00000107731 3253 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gfm2-209ENSMUST00000161825 4416 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Pikfyve-202ENSMUST00000097707 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Afap1l2-202ENSMUST00000118800 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm37539-201ENSMUST00000192644 235 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Mtmr4-202ENSMUST00000103179 5753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ccnd2-201ENSMUST00000000188 6330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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