Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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